A análise microbiológica de água consiste na detecção e quantificação de todos os microrganismos potencialmente patogênicos presentes na água.

Para detectá-los é necessário utilizar meios de cultura e estufa para criar um ambiente propício para o desenvolvimento das colônias e sua posterior identificação e/ou quantificação.

O objetivo dessas análises é fornecer subsídio a respeito da sua potabilidade. Isto é: eliminar o de risco de ingestão de microrganismos causadores de doenças, geralmente provenientes da contaminação pelas fezes humanas e outros animais de sangue quente. Vale ressaltar que os microrganismos presentes nas águas naturais são, em sua maioria, inofensivos à saúde humana. Porém, na contaminação por esgoto sanitário estão presentes microrganismos que poderão ser prejudiciais à saúde humana.